De Pinacoteca di Brera is gevestigd in het historische Palazzo di Brera, waar ook de Nationale Bibliotheek, het Observatorium, de Botanische Tuin, het Istituto Lombardo di Scienze e Lettere en de Academie voor Schone Kunsten zijn ondergebracht. Het paleis en de omliggende wijk ontlenen hun naam vanaf de oude ‘braida', wat ‘voorstedelijk veld' betekent.
In de 38 zalen van het museum worden meesterwerken tentoongesteld van belangrijke Italiaanse kunstenaars vanaf de 14e tot en met de 19e eeuw, waaronder Piero della Francesca, Mantegna, Rafaël, Caravaggio, Tintoretto, Bellini en Bronzino. Op de binnenplaats bij de ingang staat het iconische standbeeld van Napoleon I, gemaakt door Canova.
Hoogtepunten van de collectie zijn onder meer Rafaëls ‘Het huwelijk van de Maagd', Mantegna's ‘Dode Christus' en Bellini's ‘Pietà'. De Pinacoteca bewaart ook een belangrijk archief van tekeningen, dat doorgaans voorbehouden is aan wetenschappers, met werken van Leonardo da Vinci en voorbereidende schetsen van Guido Reni en Ludovico Carracci. Opmerkelijk is ook de Brera–Brambilla-tarot, onderdeel van de Visconti–Sforza-serie die in 1463 in opdracht van Francesco Sforza werd gemaakt.